2113年，地球过度开发，充满破坏欲的怪物“巴古”从虚无中出现。为了夺回人类的家园，少女凌流与伙伴们启动Ghost Code，成为铠师。在末日的废墟上，驾驭机铠与强大可怖的“巴古”展开了一场事关人类命运的死斗！

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